仕事納め

昨日１２月２８日、山口市では雪が降りました。今朝、キャンパスの田んぼには昨夜の雪がうっすらと積もっています。

雪、寒い。

研究室は今日で仕事納め。正月４日からの福岡大学での生体運動合同班会議が仕事始めになります。皆様、良いお年をお迎えください。

大掃除

本日１２月２７日、研究室の大掃除と年越しさぬきうどん大会を開催いたしました。研究室のみなさん、どうもありがとうございます。

なかむらうどんの釜玉、ものすごく美味しい。

水槽の浄化

私達の研究室では、ケラトサイト採取のために、シクリッドを４５ｃｍ水槽６つで飼っています。水槽の水は白濁したりヌルヌルすることがあります。そうなってしまったら、今までは、浄化バクテリアが自然に増えて水が透明になるまで何日も待つしかありませんでした。

ところで、私達の研究室ではワラの煮出し汁の中でゾウリムシも飼っています。ゾウリムシは汁の中で勝手に増える枯草菌を食べているのでしょう。ん、ネットのまことしやかな情報によると、枯草菌は浄化バクテリアだそうじゃないですか！？知りませんでした。

最近水槽の白濁＆ヌルヌルが消えず困っていたので、思い切ってワラ汁をドバドバ投入してみました。一晩待つときれいに透明になるじゃありませんか！茶色い透明なのが玉に瑕ですが…。

ゾウリムシ、いや、枯草菌、水槽をきれいにしてくれてありがとう。

エチブロさようなら

 DNAの電気泳動のバンドのグリーン蛍光用の撮影装置をこしらえました。
これでエチブロの煩わしさとおさらばです。

２００円の高輝度LEDを４個つないで出来上がりです。
ハイパスフィルタを通せばバンドがしっかり見えます。

最近、ケラトサイトでプラスミドDNAを発現させられるようになりました。それで、久しぶりに遺伝子を扱いだしたところ、なんと最近は発がん性のエチブロに代わって、グリーン蛍光の染色試薬がいろいろあるとのこと。これを使わない手はありません。

秋になりました

山口地方も秋になりました。

キャンパスの木が紅葉しています

車輪細胞の動画

朝日新聞さんが車輪細胞の動画を YouTube にアップしてくれておりました。こちら。
いい感じです。ありがとうございます。

岡山生物物理学会その３

学会は企業の皆さんのご支援、ご協力のおかげで成り立っています。各企業の皆様、ブースを出してくださったり、ランチョンセミナ開いてくださって、大変ありがとうございます。

励起光ダメージが少ない光シート顕微鏡を展示中のオプトラインさんブースにて。
Semrockフィルタでも大変お世話になっております。ありがとうございます。

岡山生物物理学会その２

研究室ＯＢで岡山で仕事をしている継山君と約束をして、１５日の晩御飯を一緒に食べることができました。私も沖村さんも継山くんに会えて、また、立派に働いている様子を聞けて、大変嬉しかったです。

継山くんと岡山で晩ごはん

他のOBの皆さんも是非、研究室まで連絡して下さい。

岡山生物物理学会その１

生物物理学会の年会に参加するため、岡山大学までやってまいりました。
学会に来るといつも自分のダメさに気付かされます。

生物物理学会、岡山大学です。

「数理シグナル」第２回若手ワークショップ

８月31日(金)から今日まで、琵琶湖のふちまで行って参加してまいりました、くたびれました…。
 残念ながらもう若手という歳でもないわけで。
でもいくつか非常に貴重な情報を得られました。やはり、こういう研究の集会に参加するのは非常に大切だと、あらためてじわじわ感じでいます。

論文公開

同志社大 剣持先生＆吉川先生グループの論文が公開されました。私は細胞の伸展装置の作成で少しご協力させていただきました。私では思いつけない医療応用の仕事で勉強になります。

Danno K, Nakamura T, Okoso N, Nakamura N, Iguchi K, Iwadate Y, Kenmotsu T, Ikegawa M, Uemoto S and Yoshikawa K (2018). Cracking pattern of tissue slices induced by external extension provides useful diagnostic information. Scientific Reports 8: 12167. doi: 10.1038/s41598-018-30662-9

イクラ丼

お盆休み前なので、みんなでイクラを作ってイクラ丼にして食べました。イクラを作るのは思いの外めんどくさく、シャケに産んでもらったほうが簡単なことがわかりました。苦労して作ったイクラ丼はワサビと醤油の味がしました。

シャケが産んだものと違い、たくさん食べても胃もたれしません。

academist Journal

学術系クラウドファンディングサイト「academist（アカデミスト）」さんが運営されているメディアサイト「academist Journal」 の研究コラムに、記事を書かせていただきました。こちら。掲載、大変ありがとうございます。

面白いので、ぜひ読んでください！

プレスリリース２

車輪細胞発見のプレスリリースのときの写真をいただきました。
山口大広報関係の皆様のご尽力で、とてもいい経験をさせていただきました。ありがとうございます。
記者の皆様、ありがとうございます。論文にするまで何度もガッカリしたことがありましたが、全国紙で紹介していただいて自信になりました。

車輪細胞の論文（こちら）ぜひ読んでください！基生研の野中さん＆谷口さんとの共同研究による自信作です。それにしても、野中さんのライトシート顕微鏡の威力で、初めて、ケラトサイトの車輪の回転が見えたのはもう何年も前になりますが、あの感激は今になっても忘れません。

プレゼンする沖村

質疑応答で出しゃばる私

終了後も記者の皆様は興味を持って質問してくださいました。

終了後、KRYさんにテレビ取材
をしていただく車輪鹿と沖村

プレスリリース

ケラトサイトの車輪の論文（こちら）では、プレスリリース（こちら）をさせていただき、本日１８日、いくつかの新聞等で記事として掲載していただきました。掲載してくださった各社様、記者の皆様、山口大学で広報に携わる皆様、大変ありがとうございます。

車輪で動く細胞、ワクワクしませんか？

車輪動物（車輪鹿）も見つけました！

ケラトサイトの車輪の論文が公開されました

世の中に車輪で動く生物はいません。それは地球がデコボコだから。でも生物の平らな皮膚の上ならどうでしょう？車輪生物はいなくても車輪細胞ならいるかも…。私達は魚の表皮のケラトサイトという細胞が、細胞の中で車輪を回して走り回っているのを発見しました。

Okimura, C., Taniguchi, A., Nonaka, S. and Iwadate, Y. (2018). Rotation of stress fibers as a single wheel in migrating fish keratocytes. Scientific Reports 8: 10615. doi: 10.1038/s41598-018-28875-z

ケラトサイト論文受理

本日６月２９日、ケラトサイトの遊走メカニズムに関する論文の受理のお知らせをいただきました。ホッとしました。なにはともあれ、よかった、よかった。
ケラトサイトは世にも珍しいエンジンで動いておりました。

魚類表皮ケラトサイト。カッコいい。

オオアメーバ

６月２２日に兵庫県立大の園部先生からオオアメーバ頂戴しました。
餌としてテトラヒメナを放り込むと襲いかかります。テトラヒメナの長さが 50 µm くらいだから、オオアメーバは 300 µm 以上あります。でかいです。肉眼でも見えちゃいます。

次々テトラヒメナに襲いかかるオオアメーバ。怖い。

第２回ケラトサイト採取のための釣り大会

５月１４日、ケラトサイト採取のための釣り大会に三たび行ってまいりました。メバルがたくさん釣れました。チヌも釣れてホッとしました。

カサゴ、チヌ、チャリコ、グレ、メバル、メバル・・・

論文がフィジカル・レビューＥに掲載されました。

超特急の速さで、論文が Phys. Rev. E に掲載されました。嬉しいです。

Okimura, C., Sakumura, Y., Shimabukuro, K. and Iwadate, Y. (2018). Sensing of substratum rigidity and directional migration by fast-crawling cells. Physical Review E 97: 052401.
doi: 10.1103/PhysRevE.97.052401

論文が受理されました！

下記の論文が受理されました。

Okimura, C., Sakumura, Y., Shimabukuro, K. and Iwadate, Y. (in press). Sensing of substratum rigidity and directional migration by fast-crawling cells. Phys. Rev. E.

遊走細胞はどういうわけか基質の柔らかい方向を好んで、そちらに進んでいくという内容の作品です。がん細胞や免疫細胞の遊走を化学物質を使わずにコントロールする方法に発展できるかもしれません。

初フィジカル・レビュー！
共同研究者の皆様、ありがとうございます。

フィジカル・レビューという由緒ある物理の雑誌に採択していただけたことに感激しています。コメントをくださったレビューワーの方々に感謝しています。受理原稿は元の原稿よりすごく良くなりました。頑張った甲斐がありました。

抜釘手術を受けました

　９月末に不覚にもヨロヨロと転んで左足を骨折してしまいました。それ以来、折れた骨がワイヤーで固定されていたのですが、骨も無事につながったようです。昨日、ワイヤーを抜く手術をしていただき、１泊入院して今日退院できました。

ワイヤーが抜けてスッキリした左足

　ワイヤーで骨を固定するときは、アレヨアレヨと骨折→入院→手術と事が運んで、怖がるヒマ無く、気づいたときには背骨に突き刺さる下半身麻酔の注射に悶絶していました。今回は、脂汗をかきながら身構えていたにも関わらず、どうしたわけか注射がほとんど痛くありません。痛くないならないで、こんどは麻酔が効いているのか不安になってさらに脂汗が吹き出ます。そんな私の気持ちもよそに、手術はワイヤーを抜くだけだから１０分足らずで終了です。汗たくさんかいてますね、暑かったですか？と聞かれましたが、怖かったですとは体裁が悪くて答えられません。

第１回ケラトサイト採取のための釣り大会

前回、ハオコゼぴきだった釣果を挽回しようと、４月２日、再び行ってまいりました。暖かくなって桜も咲き、潮も流れて、どっからどうみても釣れる条件です。しかし今回の釣果はカサゴ１ぴき…。ハオコゼ１ぴきよりは大進歩です。

カサゴ１ぴき。釣り上げてしまった以上、唐揚げにして頂きました。

第０回ケラトサイト採取のための釣り大会

３月２３日金曜日、昨年研究室の引っ越しで行けなかった釣りに行ってまいりました。残念ながらハオコゼ１匹という散々な釣果になってしまいました・・。

山口市内は春の陽気ですが、海は風が吹きすさび、
釣れないことも輪をかけて真冬の様相を呈しておりました。

今回を第１回というには悲しすぎるので、 第０回とさせていただこうと思います。

ニカラが来ました

手に入らずに困っていたケラトサイト実験用の魚、ニカラ２０匹ようやく手に入れることができました。研究室で飼っていたものはみな大きくなって困っていました。嬉しいです。

３ｃｍのミニニカラ。２，３年ぶりに買えました。

５研究室合同合宿

３月７〜９日、豊田ホタルの里ミュージアム・サングリーン菊川まで恒例の５研究室合同の合宿に行って来ました。博物館の先生のお話や実習はたいへん考えられていて面白かったです。

ミミズ解剖中。ミミズのカラダよくできています。馬鹿にできません。

多羅間さん来訪

３月５，６日、京大より多羅間さんグループがいらっしゃって、細胞遊走のモデルの熱い講演をしていただきました。櫻井さんも議論に加わってくださったおかげで、細胞遊走のモデルの熱い議論ができました。頭をフルに動かした２日間で大変有意義でした。

多羅間さん、バベルさんと櫻井さんと記念写真

研究室の 2018 年度が始動しました

一足早く研究室の 2018 年度が始動しました。３人の有望な学生が卒研生として配属してくれました。

新卒研生のみなさん

皆さんがんばってください。

「数理シグナル」公開シンポジウムに行ってきました

２月１０日に新学術領域「数理シグナル」の第２回公開シンポジウムに参加せていただき、沖村がポスター発表をいたしました。

東京白金台は東大医科研にて。

こうしたミーティングに参加させていただけると、脳みそが活性化されて気が引き締まります。また頑張ろう。

実体顕微鏡がやって来た

１月２９日にライカの実体顕微鏡が納品されました。何年も前から研究室に１台実体顕微鏡が欲しかったのですが、何が何でも必要な物ではなかったので後回しになってしまっていました。貧乏研究室の辛いところです・・。

Leica S9D。落射も透過も LED で現代的！
カメラもつけちゃって素敵だわ！！

本日の山口は雪です

本日の山口市はけしからぬことに雪です。
昨冬まで毎冬スタッドレスタイヤに履き替えていたのですが、過去５年ほど必要なかったので、この冬はもう履き替えるのをやめたのでした。とはいえ、万一のため、履き替え代金でスノーシューズを買ったのでした。今朝は映画八甲田山よろしく徒歩通勤です。

雪中行軍中の道（上）と
研究室のある建物の玄関（下）。

論文原稿を投稿しました

１月２２日、本日、論文原稿を１つ投稿いたしました。

昔なら論文の投稿にこぎつけると一仕事区切りがついた気分になっていたのですが、最近は論文を投稿しても全然区切りがついた気分になれません。アクセプトまでの長い長い道のりの始まりです。

消費電力が契約電力を超えそうですメール

大学にいて、夏場、消費電力が契約値を超えそうだから電気を止めなさいというメールが流れるのにはもう慣れましたが、なんと、最近、同じメールが来ました。冬もこんなメールが来るようになるとは・・。

せっせと道路を歩き（左）せっせとキャンパスを歩いて（中）
研究室にたどり着きました（右）。

今朝の山口は、めずらしく昨夜降った雪が少し残って道が凍っております。歩いてきました。ただ今、研究室の暖房を入れていますがとっても寒いです。温度計は１４度です。そんな中、もうじき「消費電力が契約電力を超えそうですメール」が乱れ飛ぶことでしょう。はぁ・・。

生体運動合同班会議

あけましておめでとうございます。
正月明けの１月５〜７日に生体運動合同班会議で東京は市ヶ谷の法政大学に行ってまいりました。沖村さんの口演は質問やコメントをいろいろいただくことができて、好評の様子でよかったです。

市ヶ谷の法政大学。私が受験生の頃とは違い
きれいなビルがそびえ立っておりました。

いつも雨でも傘もいらない、ひょっとしたら上着もいらないドアtoドアの極楽山口車生活のためか、電車や徒歩移動の東京はとんでもなく寒く感じます。