2014/12/25

大掃除

24日、研究室の大掃除をしました。

大掃除に精を出す
みなさん、お疲れさまでした。ありがとうございます。

2014/12/21

細胞力学と細胞運動の協奏


12月19、20日、新学術「ゆらぎと構造の協奏」の領域横断研究会「細胞力学と細胞運動の協奏」(九大)に参加させていただきました。
水野先生、今井先生、佐野先生、また領域のみなさま大変ありがとうございました。

人と話すと自分の仕事の足りないところがたくさん見えてきます。

2014/12/15

基生研 生物画像データ解析トレーニングコース

12月10-12日、基生研で生物画像データ解析トレーニングコースに参加してきました。

先生方の解りやすく丁寧な講義、様々な分野で研究されている参加者との交流など、
大変楽しく、充実した3日間でした。学んだことを今後の研究に活かしたいと思います。
基生研の皆様、ありがとうございました。

左から村田先生、野中先生、沖村

2014/11/14

ソーセージ

船方農場でソーセージ作りを勉強してきました。
羊の腸に豚肉を詰めて作ります。

捏ねました

できました

食べました

2014/10/27

27年度 科研費申請書 提出

毎年恒例の科研費の申請書、ようやく提出いたしました。

予算の申請書は、非常な集中力で相当の時間をかけないと良いものが書けません。
精魂尽き果てました・・・。
採択していただけることを祈ります。

さあ、また、論文や実験の仕事に戻ってがんばります!

2014/10/26

宇部高専 島袋研訪問

23日の木曜日、宇部高専の島袋研に行ってまいりました。ある電顕写真を撮っていただくためです。期待以上にうまくいきました!
島袋先生、それから、山大研究推進機構のみなさまのおかげです。ありがとうございます。

今の時代、 共同研究無しには研究は進みません。自分に無い優れた技術を持つ共同研究者が近くにいることは心強いです。
島袋先生の研究室にて

2014/09/30

生物物理学会

生物物理学会の年会(9月25−27日)で、札幌まで行ってきました。
今年度、当研究室、3回めの北海道です。
人工細胞のシンポジウムなど、一見自分たちと無関係なセッションも刺激になりました。

終了後、基生研 野中先生とジンギスカン。楽しかったです。

2014/09/12

見島

「生体における身体性知能の解明」研究会で、10ー11日、萩沖の見島へ合宿に行ってまいりました。海洋実習では、チヌやグレ、アイゴにタコまで見ることができて良かったです。
 西井先生、浦上先生ありがとう。


見島

見島をうろうろする一行


海洋実習場所へカヤックで向かう



2014/09/08

金魚入荷

ケラトサイト摘出用の金魚100尾入荷しました。

金魚。小赤の大きいので、姫と呼ぶそうです。

元気そうで、ひとまず安心しました。

2014/09/04

新学術領域「ゆらぎと構造」班会議

8月29日(土)から31日(日)にかけて北大まで行って参りました。
M2の中田さんがポスタ発表を行いました。

生物の研究者と生物物理の研究者の発想が異なるように、生物物理の研究者と生物を扱う物理の研究者の発想も少し違っています。「ゆらぎと構造」は物理の領域なので、生物物理に足場を置く我々にとって、細胞運動に新しい見方ができて勉強になります。
今回もすごく有意義な3日間でした。

サッポロビール園での懇親会でジンギスカンについて学ぶ。




2014/08/13

論文投稿しました

うまくいくことを願いつつ、本日、細胞遊走の論文を1つ投稿しました。

2014/08/09

基生研へ行ってきました

ケラトサイトの運動の仕組みを3Dで理解するために、基生研・野中研と共同研究しています。7日(木)、8日(金)とケラトサイトを持って行き、光シート型顕微鏡(DSLM)で撮影していただきました。今回で2回めの訪問です。

今回、かなり良い像が撮影出来ました!
今後を期待できる成果です。
野中さん、谷口さんご協力大変ありがとうございます。

2014/08/05

笹井先生

さきがけ「生命システム」のアドバイザーでおられた笹井芳樹先生が、本日、亡くなりました。

笹井先生は、お忙しい中、さきがけのほぼすべての領域会議にご出席くださり、私のような未熟者の発表にも、幾度もご質問、ご意見を下さいました。ご発言内容も、発表内容をただ批判するという類のものではなく、研究を良い方向に促す建設的なもので、若い研究者を育てようという姿勢がひしひしと感じられました。
いつかの領域会議で、私の発表後の休憩時間に歩み寄りアドバイス下さったことが、今も思い出されます。

大変残念です。
謹んでご冥福をお祈りいたします。

2014/08/01

金魚だらけ

本日、ケラトサイト採取用の金魚100尾が研究室に届きました。

金魚

 研究室の水槽の数がだんだん増え、水槽サイズも大型化し、管理が大変です。

2014/07/31

顕微鏡用恒温ステージできた

好中球様ヒト HL-60 細胞の元気な遊走を観察するには、細胞の温度を37度にキープしないとなりません。

売ってる恒温ステージ、むちゃくちゃ高いじゃないですか! 作りました。

恒温ステージとその制御回路。温度センサとコンパレータで温度をキープ。
スイッチングに MOSFET を使ってちょっと高級。でも CO2 は出ません・・。

伸展装置と恒温ステージで200万円くらいは節約できたかな。

2014/07/26

細胞伸展装置できた

細胞を載せた基質を繰返し伸展させる装置(Biotechniques 2009, Biophys J 2013)の2号機を作りました。
自らの電気回路の技術とそれを伝授してくれた菊山先生に感謝。

細胞伸展装置
回路作りは、箱への配線がパズルのようで、基板のハンダづけよりずっと大変。

555でワンショットマルチバイブレータを作ると、入力パルスのパルス幅よりも短い出力パルスは出せないのですね。勉強になりました。オシロで見て気づくまで、ものすごく時間がかかりました・・。

2014/07/10

論文投稿

論文、1つ投稿しました。
うまくいくといいです。

2014/07/04

宇部高専 島袋先生、江本さん来訪

4日、新学術「運動マシナリー」でご一緒し、細胞の牽引力で共同研究中の宇部高専の島袋先生と学生の江本さんが、牽引力の測定法を検討しにいらっしゃいました。

いろいろ議論をしていて、 写真を取るつもりが忘れてしまいました・・。

2014/06/30

さきがけ懇話会

分子モーター討論会(大阪)に参加させていただいた足で、6月28日、29日、の第三回 さきがけ懇話会 in 名古屋 に参加してまいりました。ご準備いただいた鈴木さん、東山さん、森田さんありがとうございます。

さきがけが終わって3年が過ぎ、メンバーの活躍ぶりを聞くと自分のダメさ加減にため息がでます。

来年の懇話会は山口で開催されます。

2014/06/29

分子モーター討論会

6月27、28日に阪大で行われた第4回分子モーター討論会(QBiC 細胞極性統御研究チーム)に参加し、ダイニンのセッションで「ゾウリムシ繊毛群のメタクロナールウェーブは細胞の弾性を利用して伝播するか?」という演題で、口演させていただきました。

予想以上に好評で嬉しく、また、今後の発展に向けて大変有用なご意見を頂戴でき興奮しました。
お招きくださった小島先生、岡田先生大変ありがとうございます。

2014/06/20

新学術領域「運動マシナリー」班会議

6月16日(月)ー18日(水)、北海道・旭川に新学術「運動マシナリー」班会議に参加し、ゾウリムシのメタクロナールウェーブの口頭発表をさせていただきました。

自己評価以上に好意的に受け入れられました。数理モデルと実験をうまく融合させる研究は認めていただけるものだと実感しました。一方、問題点も明白なので、早く解決して期待以上の成果を上げなくてはなりません。

メタクロナールウェーブが綺麗なゾウリムシ taken by Narematsu N


出張期間中、旭川がずっと雨模様だったのが残念でした・・。

2014/06/01

ラージプレップ

卒業生が、日曜日に、実験技術を後輩に伝授しに来てくれました。

西村くんありがとう。上田くん頑張れ。

2014/05/23

ISMB 2014

岡山大学で行われた International Symposium on Mechanobiology 2014 に参加させていただきました。
成瀬先生はじめ主催者の方々、セッションにお誘いくださった出口先生、大変有難うございます。

基質伸展刺激下での粘菌とケラトサイトの運動について口演させていただきました。英語だと言いたいことの半分くらいしか言えなくて歯がゆいです。

2014/05/02

2014年春 第4回 ケラトサイト採取 チヌ釣り大会

いつもの釣り場でのっこみチヌが釣れるのはゴールデンウイークまでです。今日は最後のチヌ釣り大会です。大量のアジと1尾のキスが釣れました・・。チヌはアジが去った後でしか釣れません,アジは・・,去りませんでした。

アジは餌をくわえると一気に走るため,針掛かりするとウキがすごい勢いで沈みます。一方,チヌは,餌をまずつついて様子見し,しばし後,その場で食います。そのため,ウキはまず,わずかに入り,その後でスウッっと静かに沈みます。
ウキがわずかに入ってから沈むまでの緊張感はたまりません。さらに,合わせてからのチヌの強烈な引きは格別です。一方,すごい勢いでウキが沈み,いかなる巨大魚が来たかと思い,合わせた時のアジの拍子抜け感もたまりません・・。

アジが掛かりました・・。悲しい瞬間です。

アジのケラトサイトが,偏差が少なく,みな高速で動くことが確認できました。キスのケラトサイトは普通でした。

キスのケラトサイト by Okimura C

2014/04/27

新学術領域「ゆらぎと構造」公募班キックオフ研究会

昨日,今日,初顔合わせの研究会で京大に行って参りました。
非平衡・非線形物理の新学術領域にどれだけついていけるか不安もありますが,生命現象の代表として採択していただいているので,領域を盛り立てられるよう2年間頑張ります!

2014/04/16

チヌのケラトサイトの観察に成功

チヌのケラトサイトを初めて観察できました!
チヌのウロコは1cm近くある巨大サイズなのに,ケラトサイトのサイズはチヌも金魚も同じです。

Keratocytes from チヌ by Okimura C
 遊走中,形があまり安定しません。元気が無いのでしょうか。


昨日のチヌ。どれも43cm!


2014/04/15

2014年春 第3回 ケラトサイト採取 チヌ釣り大会

お腹が卵でパンパンののっこみチヌが3尾釣れました。

43cmでした。ケラトサイトも採取しました。

竿から手に伝わる手応え,やがて海面に現れる美しい黒鯛の魚体からは,スーパーの魚はもちろん,水族館の魚ともまた違う野生の命を実感します。生物学者は DNA やタンパク質だけでなく“生きもの”そのものを知らないといけません。
ケラトサイトも忘れずに採取しました。

こちらも43cm。研究室でもケラトサイトを採取します。
お刺身。


2014/04/10

平成26年度 基生研 共同利用研究 採択

基生研では,野中茂紀先生が光シート型顕微鏡(DSLM)という素晴らしい光学顕微鏡を構築されています。

平成26年度 DSLM 共同利用実験に採択していただきました。大変ありがとうございます!
ケラトサイトの運動を3次元で捉えられると期待しています。

2014/04/09

ケラトサイトで GFP ミオシン II 発現成功!

ケラトサイトは継代培養不可能で,魚から採取した初代培養の細胞でしか実験できません。細胞数が限られプラスミドの導入が難しく,また,細胞分裂しないため核内にプラスミドが入るのかすらわかりません。
そんなわけで,ケラトサイトは細胞遊走の魅力的な実験材料にも関わらず,生きたケラトサイトでの GFP 融合タンパクの観察は,私の知る限り,世界中で2つのグループから2,3の単発の論文が発表されているだけです。GFP ミオシン II に至っては,誰も見ていないはずです。

我々の開発したエレクトロポレータで,産総研の長崎さん,上田さんから提供されたプラスミドを導入したところ,悲願であった GFP ミオシン Ⅱ の観察に成功しました!感動です。

GFP-myosin II in a live keratocyte taken by Okimura C
長崎さん,上田さん,エレクトロポレータ開発者の継山くん,ありがとうございます!

2014/04/08

平成26年度 科研費

新学術領域「ゆらぎと構造」公募研究,挑戦的萌芽研究にそれぞれ新規採択していただきました。
大変ありがとうございます。

2014/04/07

理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理」

4月3日(木)ー4日(金)理化学研究所和光本所(和光市)にて,佐甲靖志先生主催,理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理」にお招きいただき,参加・口演させていただきました。

我々の遊走の仕事は萌芽的でまだまだ定性的なデータしか出ていないにもかかわらず,大変暖かく迎えていただきました。佐甲先生,佐甲細胞情報研究室のみなさま,ありがとうございます!

2014/03/28

「生体における身体性知能の解明」研究会

 我々の研究室は理学部 情報科学分野 西井先生の主催する「生体における身体性知能の解明」研究会に参加しています。

26日から27日にかけて,西井研,浦上研と鹿児島に合宿に行ってまいりました。学際的な研究グループの討論会は,脳に普段と違う刺激が入るので,発想が柔軟になります。

討論会
いおワールドかごしま水族館では,魚の骨格標本の特別展示ばかりか,水槽のバックヤード解説まで丁寧にしていただきました。我々の研究室では,60cm水槽5つ,45cm水槽2つで魚を飼っています。バックヤード解説は魚の飼育の勉強にすごくなりました。

魚の骨格標本(特別展示「とうめいになった魚たち」より)
バックヤード見学。スタッフの土田さん(中央)ありがとうございます!



桜島の火山灰の雨には驚きました。

桜島噴火中


2014/03/20

卒業式

本日,山口大学の卒業式です。我々の研究室からは修士1名,学士2名が卒業いたしました。

卒業おめでとうございます。

2014/03/17

2014年春 第2回 ケラトサイト採取 チヌ釣り大会

アジが1匹釣れました・・・。
釣れん…。

ケラトサイトは採取出来ました!!
アジから取った keratocytes (by Okimura C)


2014/03/14

2014年春 第1回 ケラトサイト採取 チヌ釣り大会

普段は金魚や熱帯魚のケラトサイトを実験に使っていますが,海の魚のケラトサイトを一度見てみたいと思っています。 釣れませんでした・・。

ボウズ・・

2014/02/21

来年度卒研生初出勤

2014(平成26)年度卒研生が本日より研究室に通い始めました。当研究室にふさわしい男子3名に期待しています。

2014/02/19

九大医 武谷立先生ご来訪

九大 武谷先生,院生の牛島さん,マイクロエレクトロポレーターをお試しに研究室にいらっしゃいました。遠いところありがとうございました。実験がうまくいくと嬉しいです。

左から武谷先生,牛島さん,岩楯,沖村さん,開発者の継山君

2014/02/17

卒論発表会

今日,明日は山口大学 理学部 生物学系研究室 卒業論文発表会です。
当研究室の発表は今日,無事終了しました。

  • ケラトサイトの形の魚種による違いから考える形の決定要素 藤井君
  • 好中球様 HL-60 細胞の繰返し基質伸展刺激下での運動とそのメカニズム 西村君

2014/02/14

研究室ブログ始めました

研究室のニュースはウェブサイトのほか今後こちらでも紹介致します。

直島のかぼちゃ 2013年5月
(生物物理学会中国四国支部大会にて。素晴らしい支部大会でした。)

学振採択おめでとうございます。

当研究室の清水君が学振DC2に採択していただけました! 清水君おめでとうございます。